近日,國(guó)際著名學(xué)術(shù)雜志《Cell》旗下的綜述子刊《Trends in Genetics》在線(xiàn)發(fā)表了華僑大學(xué)醫(yī)學(xué)院徐冬旸博士和菲利普教授關(guān)于RNA靶向富集測(cè)序技術(shù)的綜述文章,文章題為“Complexities of Mammalian Transcriptome Revealed by Targeted RNA Enrichment Techniques”。
《Trends in Genetics》是《Cell》出版社于1985年創(chuàng)立的綜述類(lèi)子刊(IF=11.821,JCR 1區(qū)TOP),主要發(fā)表遺傳學(xué)領(lǐng)域的重要進(jìn)展和最新研究發(fā)現(xiàn)的綜述類(lèi)文章,創(chuàng)刊以來(lái)刊登過(guò)許多重大生命科學(xué)研究進(jìn)展,全年刊出文章約為70篇。
21世紀(jì)初,分子生物學(xué)的“中心法則”由于人類(lèi)基因組存在的普遍轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象(暗物質(zhì)RNA)的發(fā)現(xiàn)而受到挑戰(zhàn),即人類(lèi)基因組存在大量未被注釋的暗物質(zhì)RNA,它們沒(méi)有明顯的編碼能力卻廣泛存在于各種細(xì)胞類(lèi)型中。相關(guān)發(fā)現(xiàn)引起了廣泛的關(guān)注和大量研究者的興趣,然而由于技術(shù)的局限對(duì)人類(lèi)基因組和轉(zhuǎn)錄組的認(rèn)識(shí)仍十分有限。
近年來(lái)多項(xiàng)基于RNA靶向富集測(cè)序技術(shù)的研究為該領(lǐng)域帶來(lái)了新的認(rèn)知。這些研究表明人類(lèi)轉(zhuǎn)錄組以復(fù)雜的、交錯(cuò)的方式轉(zhuǎn)錄,蛋白質(zhì)編碼和非編碼基因位點(diǎn)均產(chǎn)生大量而復(fù)雜的可變剪接轉(zhuǎn)錄物。這些結(jié)果與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的研究結(jié)果相互印證,并清楚地證明了我們對(duì)人類(lèi)轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的理解和研究遠(yuǎn)未完成。此次,徐冬旸博士和菲利普教授發(fā)表的文章回顧了當(dāng)前RNA靶向富集測(cè)序技術(shù)的現(xiàn)狀、其在發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄本研究中的應(yīng)用,并討論了其對(duì)進(jìn)一步理解人類(lèi)基因組和轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性可能起到的重要作用。
該文章的署名單位為華僑大學(xué)醫(yī)學(xué)院,醫(yī)學(xué)院徐冬旸博士為第一作者,博士生唐露為第二作者,菲利普·卡帕諾夫教授為通訊作者,該研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金和華僑大學(xué)科研基金的資助。
文章鏈接:
https://www.cell.com/trends/genetics/fulltext/S0168-9525(22)00313-4?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0168952522003134%3Fshowall%3Dtrue
(編輯:張婷玉)