近日,華僑大學(xué)醫(yī)學(xué)院基因組學(xué)研究所PhilippKapranov教授團(tuán)隊(duì)在《BMC Biology》(JCR一區(qū)TOP期刊)上在線(xiàn)發(fā)表了題為“Very long intergenic non-coding (vlinc) RNAs directly regulate multiple genes in cis and trans ”的文章。這是該團(tuán)隊(duì)在vlincRNA研究中的最新進(jìn)展。
針對(duì)目前在lncRNA功能研究方法中由于缺乏獨(dú)立交叉驗(yàn)證而使lncRNA功能的真實(shí)性仍不明確的研究難點(diǎn),該研究創(chuàng)新性地提出整合三種不同類(lèi)型的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究策略,即整合lncRNA-基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)、lncRNA-染色質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和lncRNA-CRISPR/Cas13敲低的分子效應(yīng)網(wǎng)絡(luò)這三種不同類(lèi)型的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),來(lái)注釋lncRNA功能,并用該方法成功注釋了一種新的廣泛分布的lncRNA亞類(lèi)——vlincRNA,研究結(jié)果有新發(fā)現(xiàn)。
華僑大學(xué)醫(yī)學(xué)院基因組學(xué)研究所曹慧芬博士為該論文的第一作者;徐冬旸博士,博士生蔡燁、韓雪兒為共同第一作者;博士研究生唐露、高帆、王芳、陳越等參與了此項(xiàng)研究。PhilippKapranov教授為論文的通訊作者。